In der A1-Kollaboration sind die Experimente zur Elektronenstreuung an MAMI zusammengefasst. Diese Experimente zielen insbesondere drauf ab, die räumliche Struktur von Atomkernen oder Kernbausteinen zu untersuchen.
Unter dem Schlagwort reelle Photonen sind Experimente zusammengefasst, die einen sekundären Photonenstrahl zur Untersuchung von Atomkernen, Kernbausteinen und weiteren stark wechselwirkenden Teilchen Hadronen verwenden.
Die X1-Arbeitsgruppe entwickelt am Mainzer Mikrotron MAMI neuartige brillante Strahlungsquellen und erforscht deren Anwendungspotential. Das Spektrum reicht vom fernen Infraroten bis hinein in den harten Röntgenbereich.